كنائس الدير:

اهتــم نيافــة الأنبــا بيشــوى بتعميــر وإنشــاء كنائــس فــي الديــر ، واكتشــف فــي حبريتــه كنيســتين أثريتين إحداهمــا أُكتشــفت فــي عــام 1974م ، والأخــرى أُكتشــف مذبحهــا البحــرى فــي 1999م ، أمــا مذبحهــا القبلــى وباقــى الكنيســة أُكتشــفت فــي 2005م . وبــذل مجهوداتــه لإرجــاع كل مــا كان أثريًــا إلــى شــكله الأثــرى ، وقــام بتعميرهــم علــى الطــراز الأثــرى مــن قبــاب وحوائــط وترميــم الحجــاب

١- الكنيسة الكبرى وملحقاتها

٢- الكنيسة الوسطى كنيسة الشهيد مارجرجس المزاحم

٣- كنيسة القبر

أعــاد نيافــة الأنبــا بيشــوى المذبــح الأثــرى الــذى أمــام قبــر الشــهيدة دميانــة إلــى وضعــه الأصلــى بعــد تعليتــه وتغليفــه بالرخــام فــي الجــزء العلــوى الجديــد وأحضــر نيافتــه جــزءًا مــن خشــبة الصليــب المقــدس وجــزءًا مــن جســد الملكــة هيلانــة ووضعهمــا فــي خزانــة داخــل المذبــح الأثــرى للكنيســة ، ثــم قــام بإزالــة الســقف الخشــبى وعمــل ســقف خرســانى بــدلاً منــه ، مــع المحافظــة علــى القبــة الأثريــة فــوق القبــر والأعمدة الأثريــة التــى تحملهــا وتــم تشــطيب الكنيســة والقبــر بالحجــر الطبيعــى علــى طــراز القــرن الرابــع وإحاطــة القبــر بســور زجاجــى مــع الحديــد الكريتــال . وزيّنــه بأيقونــات أثريــة، وأضــاف إليهــا بعــض أيقونــات مــن عمــل راهبــات الديــر وجعــل نوافــذ كنيســة القبــر أيقونــات مــن الزجــاج المعشــق مــن عمــل راهبــات الديــر . وقــد أشــرف أحــد محبــى القديســة دميانــة علــى أعمــال تشــطيب كنيســة القبــر وإعطائهــا الصبغــة الأثريــة التــى تليــق بهــا مســتعينًا بخبــراء مــن سويســرا فــي الفــن والمعمــار وفــي أكتوبــر عــام 1998م قــام بترميــم منــارة كنيســة القبــر وتعليتهــا ، وجعــل نهايتهــا بشــكل قبــة علــى الطــراز القبطــى وأعيــد بياضهــا ببيــاض الحجــر الصناعــى . وفــي عــام 2003م قــام نيافتــه ببنــاء المنــارة الأخــرى علــى نفــس الطــراز

٤- كنيسة القديسة دميانة الأثرية

هــى أقــدم كنيســة أثريــة فــي الديــر، ســعى نيافتــه للبحــث والتنقيــب عــن الكنيســة الأثريــة، واكتشــفها فــي 1974م ، وتــم إزالــة مــا كان فوقهــا مــن ردم . وصلــى قداســة البابــا شــنوده الثالــث القــداس الإلهــى الأول فيهــا فــي 1975/5/8م واهتــم نيافتــه أيضًا بترميــم وتبخيــر حامــل الأيقونــات الأثــرى للكنيســة ، ورفــع الكنيســة التــى بأعلاهــا وفــي مــارس 2003م أُعيــد بنــاء قبابهــا وإعادتهــا إلــى وضعهــا الأصلــى الــذى كانــت عليــه وذلــك بالاتفــاق مــع مصلحــة الآثــار وتحــت إشــرافها . وكذلــك تــم عمــل بــلاط أرضيــة الكنيســة مــن الحجــر واســتكملت المعموديــة واللقــان

٥- كنيسة الأنبا أنطونيوس الأثرية

طلــب نيافــة الأنبــا بيشــوى القيــام بالبحــث والتنقيــب فــي الأرض بيــن كنيســة القبــر والكنيســة الأثريــة القديمــة ، وأثنــاء التنقيــب تــم اكتشــاف مذبــح أثــرى لكنيســة أثريــة فــي يــوم 1999/6/4م – وهــى كنيســة الأنبــا أنطونيــوس الأثريــة – وظهــر الحائــط البحــرى مــن جهــة المذبــح ، وفتحــة بــاب الهيــكل ،

صــدر فــي عــام 2005م قــرار مــن هيئــة الآثــار بهــدم وإعــادة بنــاء كنيســة الأنبــا أنطونيــوس . وذلــك لأن الكنيســة التــى بناهــا المتنيــح الأنبــا باســيليوس مطــران أورشــليم القــدس ودميــاط والبــرارى قــد آلت للســقوط

فــي 7 ســبتمبر 2005م أثنــاء عمليــه الهــدم وإزالــه الأساســات ، ظهــرت الدلائــل علــى وجــود باقــى أجــزاء الكنيســة الأثريــة الســابقة المكتشــفة فــي 1999/6/4م ، فظهــر الحائــط القبلــى والمذبــح القبلــى فــي يــوم ١٠ / ٩ / ٢٠٠٥ تحــت الكنيســة التــى بناهــا الأنبــا باســيليوس . وبعــد ذلــك ظهــرت بدايــات العقــود الحاملــة للقبــاب ، ومقصــورات القديســين بالحوائــط . بــل وظهــرت أيضً ــا شــرقية الهيــكل . وقــد رأى نيافتــه أن يتــم اســتكمال هــذه المبانــى بنفــس الطــراز المعمــارى والمونــة الثلاثيــة – القصرمــل – وحجــم وشــكل الطــوب للمبانــى الأثريــة بالديــر كمــا تــم عمــل بــلاط أرضيــة مــن الحجــر الطبيعــى بالطــراز الأثــرى ، واســتكمال ســقف الكنيســة بثــاث قبــاب مــن الجهــة القبليــة ، وبشــكل نصــف برميــل خشــبى مــن الجهــة البحريــة

٦- كنيسة العذراء مريم بمبنى الراهبات القديم

٧- كنيسة القديسة دميانة

٨- كنيسة الملاك ميخائيل