تــم ترميــم كنيســتي العــذراء – والأنبــا أنطونيــوس والأنبــا بــولا وإصــاح القبــاب والأرضيــات وإصــلاح حامــل الأيقونــات والدهانــات مــع الاحتفــاظ بالطابــع الآثــري فــي عــام 1992م تــم اســتخراج تصريــح مــن هيئــة الأثــار بإحــلال وتجديــد وترميــم بالســور الأثــرى تحــت الأثــار

صحــن الكنيســة يتوســطة أربعــة أعمــدة مســتديرة تحمــل القبــاب وأعمــدة الكنيســة وقبابهــا مزخرفــة بالطــوب المحــروق والملــون بالاســود والاحمــر تذكــر الزائــر بشــهداء أخميــم الذيــن مــأت دماؤهــم حوائــط الكنيســة عنــد احتفالهــم بعيــد الميــاد فــي عهــد أريانــوس ودقلديانــوس